PP220_ASFM2
Polyprotein pp220
MGNRGSSTSSRPPLSSEANIYAKLQDHIQRQTRPFSGGGYFNGGGDKNPV
QHIKDYHIDSVSSKAKLRIIEGIIKAISKIGFKIDTKQPIEDILKDIKKQ
LPDPRAGSTFVKNAEKQETVCKMIADAINQEFIDLGQDKLIDTTEGAASI
CRQIVLYINSLTHGLRAEYLDVHGSIENTLENIKLLNDAIKQLHERMVTE
VTKAAPNEEVINAVTMIEAVYRRLLNEQNLQISILTNFIDNILTPTQKEL
DKLQTDEVDIIKLLNDTNSVLGTKNFGKVLSYTLCNLGIAASVANKINKA
LQRVGLKVEQYLQSKNWAEFDKELDLKRFSGLVSAENIAEFEKAVNLLRQ
TFNERHKILENNCAKKGGDEVKTPLDKRIEAQRLDRKHILMEFLNKSTQA
YNDFLENVKKIGIKLVKEIALTPNITRLRDALSRINDMGTIALDLSLIGF
YTNAAAREERETFLTQLTLVKNVLEEISKTDPNFKNLYDSCFRLLQIIDF
YTDIVQKKYGGGEDCECTRVGGAALTVEELGLSKAARSQVDLNQAINTFM
YYYYVAQIYSNLTHNKQEFQSYEENYATILGDAIAGRLMQLDTEKNARIN
SPAVDLARGHVGPNPGGAQEVDWKAAVSAIELEYDVKRRFYRALEGLDLY
LKNITKTFVNNIDSIQTVQQMLDGVRIIGRWFTEATGDTLAQVFESFPTS
AGNDSNVFTDNAPAGHYYEKVAAEIQQGRSVGTLRPVRASQAKNIRDLIG
RSLSNFQALKNIINAFARIGDMLGGEELRQMVPMSPLQIYKTLLEYLQHS
ALSVGLKNLNQSEIGGQRMALAQTAEEAAQRVYLSTVRVNDALSSRWETE
DMFFTFMLKSMAAKIFIVLGIYDMFERPEPVYKLIPTRMILGGADELEPE
VIPEAAELYFRLPRLAEFYQKLFSFRDGNVQISMLPELEGIFSGLIRIIF
MRPIELINIGDYSETEIRQLIKEINVIYQHFNLEYGEQEATKKALIHFVN
EINRRFGVITRTEWEKFQRIVQEARTMNDFGMMNQTNYSILPDEDGYTQS
SQLLPSDRFIGPSSQPTPKWRPALYNIDSVDVQTGMLQPNSQWDLVQKFR
KQLSEMFEDPSLQQELGKISYQELIRQAINELKKEHTDKIQIVSKLIQGS
ESLADTDVNKIFLFHETVITGLNLLSAIYVLLNNFRNNIKGLDLDTIQKS
IIEWLRETQPPDVNHANLLDWLGRKHGAISEIRNPGLVVKANNARLSEVY
PDPTTDANTPQDRNLTTETLFAWIVQYVGIPAGGGVRPEQELAARYLVDN
QRIMQLLLTNIFEITSSFNKMIQVRFPETSTAHVHLDFTGLISLIDSLMA
DTKYFLDLLRPHIDKNIIQYYENRSNPGSFYWLEEHLIDKLIKPPTDARG
RPLPGGELGLEGVNQIINKTYTLLTKPYNVLQLRGGAQRRDAANIQINNN
PQSSERFEQYGRVFSKLVFYDALENNSGLRVEQVALGDFRLSNLIRTNNA
QEENTLSYWDNIALRTYANVNDAANNLRRYRLYGSDYGIQNNRSMMMVFN
QLIASYITRFYDAPSGKIYLNLINAFANGNFSQAVMEMGYAHPDLARNNN
AFGHRGDPTEQSVLLLSLGLILQRLIKDTNRQGLSQHLISTLTEIPIYLK
ENYRANLPLFNKMFNILISQGELLKQFIQYTNVQLARPNLTALLRANNDS
VIYYNNNNVPMTGLSIGQAAMRGIGGVFRPNVTLMPLGDAQNNTSDIVRK
RLVAVIDGIIRGSHTLADSAMEVLHELTDHPIYLETEEHFIQNYMSRYNK
EPLMPFSLSLYYLRDLRIENNEVYDPLLYPNLESGSPEFKLLYGTRKLLG
NDPVQLSDMPGVQLIMKNYNETVVAREQITPTRFEHFYTHAIQALRFIVN
IRSFKTVMTYNENTFGGVNLISEDRNDKPIITAGIGMNAVYSLRKTLQDV
ISFVESSYQEEQINNIHKIVSPKGQTRTLGSNRERERIFNLFDMNIIPIN
VNALMRSIPLANIYNYDYSFEEIACLMYGISAEKVRSLNTAAPQPDVAEV
LNIPNRPPINTREFMLKLLINPYVSVSITQYGNELLSKGNAGYMSRIFRG
DNALNMGRPKFLSDQIFNKVLFGSLYPTQFDYDEAGPSLAAGIQRGRERW
GHPMSIYINQALHEIVRTIRLAETVRGLRNVIDRNQIIGELNAFRTQLED
TLREVNNLVQTPEIQNNPTPEIIAAVQNWGQQYRAQITDLIDLIGNAGQA
NSMISLIQNINVQTAGAQLTALFNRRGLPAPPPRQVLQNDIEAIQWFMTI
VINHPPILIAPFMLLVNNLKEFLNTLERYVYKTPRWLGPGTARIAQPPVG
MAPGINMRHHTSYTENSVLTYITEQNREEGPWSIVKQVGVGIQKPTLVQI
GKDRFDTRLIRNLIFITNVQRLLRLRLNLELSQFRNVLVSPDHIINPSIT
EYGFSITGPSETFSDKQYDSDIRIL
Legend:
Inside
Membrane
Outside
Re-entrant loop
Beta barrel inside
Periplasm
Interfacial helix
Legend:
Inside
Membrane
Outside
Re-entrant loop
Beta barrel inside
Periplasm
Interfacial helix